부가가치세

간이과세 → 일반과세로 전환됐다면, '재고품 매입세액 공제' 꼭 챙기세요!

전창로 세무사조회 8

안녕하세요, 명륜세무회계 전창로 세무사입니다.

지난 2026년 상반기 부가세 신고 안내 글에 이어,
이번에는 특별히 간이과세자에서 일반과세자로
새롭게 전환되신 사장님들을 위한 절세 팁을 하나 준비했습니다.

매출이 늘어서 일반과세자로 전환되었다는 건
사업이 그만큼 잘 되고 있다는 뜻이니 정말 축하드릴 일이지만,
동시에 과세 유형이 바뀌면서 신경 써야 할 세금 업무도 하나 늘어나게 됩니다.

7월 부가세 확정신고 시즌은 이미 지났지만,
혹시 이번에 소개해 드릴 '재고품 매입세액 공제'를 미처 챙기지 못하고 지나치셨다면
지금이라도 확인해두시는 게 좋습니다.

이 공제는 전환 초기 부가세 부담을 상당히 줄여줄 수 있는데,
의외로 모르고 넘어가시는 분들이 많거든요.

신고 시기를 놓쳤더라도 대응 방법이 있으니, 끝까지 꼭 읽어보시길 권해드립니다.

어떤 기준으로 일반과세자로 전환되나요?

개인사업자는 부가세 과세 유형에 따라 일반과세자, 간이과세자, 면세사업자로 나뉘는데,
면세사업자는 학원이나 병원, 농수산물 판매업처럼 일부 특수 업종에만 해당되기 때문에
대부분의 자영업 사장님들은 일반과세자 또는 간이과세자로 등록하시게 됩니다.

일반과세자와 간이과세자 두 유형을 가르는 기준은 매출액입니다.

직전 연도 연 환산 매출액이 1억 400만 원 이상
(부동산 임대업 및 과세유흥장소는 4,800만 원 이상)이면 '일반과세자'로 분류되고,
그 미만이면 '간이과세자'로 분류됩니다.

처음에 간이과세자로 사업자등록을 하셨더라도
매출이 이 기준을 넘어서면 그해 7월 1일부터 자동으로 일반과세자로 전환되는 구조입니다.

일반과세 - 간이과세 → 일반과세로 전환됐다면, '재고품 매입세액 공제' 꼭 챙기세요! 이미지 1

재고품 매입세액 공제란 어떤 제도인가요?

간이과세자였다가 일반과세자로 전환되면,
그날 이후부터는 예전부터 갖고 있던 재고품을 팔 때도
공급가에 10%의 부가세를 얹어서 판매해야 합니다.

그런데 그 재고품을 구입할 당시에는 간이과세자 신분이었기 때문에 문제가 하나 생깁니다.

일반과세자는 매입세액을 원칙적으로 전액 공제받지만,
간이과세자는 매입액(공급대가)의 0.5%만 공제받을 수 있기 때문이죠.

예를 들어 간이과세자 시절에 원재료를 110만 원
(공급가 100만 원 + 부가세 10만 원)에 구입했다고 가정해보겠습니다.

실제로 부담한 부가세는 10만 원이지만,
간이과세자로서 공제받은 금액은 110만 원 × 0.5% = 5,500원 정도에 불과합니다.

그런데 일반과세자로 전환된 뒤 이 재고를 판매할 때는 부가세 10%를 온전히 다시 내야 하니, 사실상 같은 재고에 대해 세금을 이중으로 부담하는 것처럼 느껴질 수 있습니다.

일반과세 - 간이과세 → 일반과세로 전환됐다면, '재고품 매입세액 공제' 꼭 챙기세요! 이미지 2

국세청에서는 이런 불균형을 바로잡기 위해,
전환 시점에 해당 사업체가 원래부터 일반과세자였다고 간주하고
간이과세자 시절 부족하게 공제받았던 매입세액을 추가로 돌려주는 제도를 운영하고 있는데, 이것이 바로 재고품 매입세액 공제입니다.

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어떤 자산에 적용되나요?

부가세법에서는 이 공제를 받을 수 있는 대상을
'일반과세자로 변경되는 날 현재 보유하고 있는 재고품 및 감가상각 자산' 중
매입세액 공제 대상으로 분류된 자산으로 정해두고 있습니다.

구체적으로 다음과 같이 나뉩니다.

1. 상품, 제품, 반제품, 재공품, 원재료, 부재료 등 재고 자산
2. 건설 중인 자산
3. 감가상각 자산
(건물이나 구축물은 취득 후 10년 이내,
그 외 감가상각 자산은 취득 후 2년 이내인 경우에 한정)

가게 상황에 맞춰보면, 판매용 상품 재고나 식자재·포장재 같은 원재료뿐 아니라
인테리어 비용 중 자산으로 분류된 부분,
일정 기간 이내에 들여온 비품이나 기계장치도 공제 대상에 포함될 수 있습니다.

일반과세 - 간이과세 → 일반과세로 전환됐다면, '재고품 매입세액 공제' 꼭 챙기세요! 이미지 4

공제액은 어떻게 계산하나요?

자산 유형별로 적용하는 계산식이 조금씩 다른데,
가장 많이 해당하실 재고품(상품·제품·원재료 등)에 대한 공식은 다음과 같습니다.

⚠️ 계산식에서 재고금액은 부가세가 포함된 취득가액
(장부 또는 세금계산서로 확인되는 금액)을 기준으로 합니다.

2021년 7월 1일 이후 공급받은 경우:
재고매입세액 = 재고금액(VAT 포함) × (10 / 110) × (1 − 0.5% × (110 / 10))

2021년 6월 30일 이전에 공급받은 경우:
재고매입세액 = 재고금액(VAT 포함) × (10 / 110) × (1 − 업종별 부가가치율)

건설 중인 자산이나 감가상각 자산은 직접 매입한 것인지
아니면 스스로 제작·건설·신축한 것인지 여부, 자산의 종류, 보유 기간에 따라
각각 별도의 계산식이 적용되므로 신고 전에 꼼꼼히 확인이 필요합니다.

일반과세 - 간이과세 → 일반과세로 전환됐다면, '재고품 매입세액 공제' 꼭 챙기세요! 이미지 5

신고 기한을 놓쳤다면 어떻게 하나요?

이 공제는 자동으로 적용되는 것이 아니라 사업자가 직접
'일반과세 전환 시의 재고품등 신고서'를 작성해 관할 세무서에 제출해야만 받을 수 있습니다.

세법에서는 '일반과세자로 변경되는 날의
직전 과세기간에 대한 신고와 함께 신고한다'고 규정하고 있습니다.

7월 1일을 기준으로 일반과세자로 전환된 사업자라면
직전 과세기간은 그해 1월부터 6월까지가 되고,
이 기간에 대한 부가세 확정신고는 원칙적으로 7월 1일부터 25일 사이
(2026년에는 27일 월요일까지 연장)에 이뤄졌습니다.

즉, 재고품 매입세액 공제 신고도 이 7월 확정신고 기간에 함께 처리하는 것이 원칙입니다.

만약 이번 신고 기간에 이 공제를 미처 챙기지 못하셨더라도 방법이 아예 없는 건 아닙니다.

공제 요건에 해당하는데 신고를 누락하셨다면,
경정청구 등을 통해 사후에 바로잡을 수 있는 여지가 있으니
관할 세무서나 담당 세무사에게 본인 상황이 해당되는지 문의해보시는 것을 권장드립니다.
(구체적인 인정 범위나 절차는 개별 사안에 따라 달라질 수 있어, 반드시 확인이 필요합니다.)

신고서 제출 후에는 관할 세무서장이 재고금액을 조사·승인하고,
승인된 날이 속하는 과세기간에 매출세액에서 실제 공제가 이루어집니다.
세무서에서 별도 통지가 없더라도 신고 후 90일이 지나면 자동 승인된 것으로 봅니다.

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혹시 지금 확인하신다면 이 자료들을 챙겨두세요

본인이 공제 대상에 해당하는지, 또는 신고 누락분을 정정할 수 있는지 확인하실 때
다음 항목들을 미리 정리해두시면 훨씬 수월합니다.

- 전환일 현재 남아 있던 재고 리스트 (품목, 수량, 단가, 부가세 포함 총액)
- 최근에 취득한 사업용 자산 리스트 (취득일, 금액, 세금계산서 여부)
- 간이과세자 시절 받아둔 세금계산서나 카드매출전표 등 증빙 자료

이 자료를 정리해두시면 홈택스에서 확인하실 때도,
세무사에게 문의하실 때도 훨씬 빠르게 진행할 수 있습니다.

일반과세 - 간이과세 → 일반과세로 전환됐다면, '재고품 매입세액 공제' 꼭 챙기세요! 이미지 7

7월 부가세 신고 시즌은 지나갔지만,
재고품 매입세액 공제는 전환 초기 부가세 부담을 확실히 줄여주는 제도인 만큼 아직 챙기지 못하셨다면 지금이라도 꼭 한 번 확인해보시길 권해드립니다.

생각보다 모르고 그냥 지나치시는 사장님들이 꽤 많은 항목이거든요.

혹시 전환일이나 재고 상황, 또는 신고 누락 정정 가능 여부가 애매해서 헷갈리시는 부분이 있다면 댓글로 남겨주시면 함께 살펴봐드리겠습니다. 무더운 여름날 매장 지키시느라 고생 많으신데, 남은 하반기에는 매출이 더 쑥쑥 오르시길 응원하겠습니다!

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